天地蒙鸿，萌芽兹始，盘古持神斧开混沌，其精魄化为“金、木、水、火、土”五行。五行构成日月山河，天地至此诞生。

盘古体内灵气久聚不散，化为“伏羲、女娲、神农”三皇。三皇依照各自的形像创出世间生灵，并将这些生灵归属于“天、地、冥”三界。纭纭众生，皆属三界，三皇为治世，又将生灵置于“神、魔、妖、人、鬼、兽”六道中，让众生在其间流离轮回、生死无休。

三界六道，以神为尊，主宰天地。然而，“风、雷、火、雪、水、山”六神却是好勇斗狠，至使斗转星移，四季难分。三界内天灾不断，妖魔趁机肆虐人间，苍生陷入空前厄恶。

人皇女娲为解苍生之劫，先将风、雷二神镇于南蛮和昆仑之巅。又在轩辕地宫前降服火神；雪神、山神自知难敌女娲，逃至人间，销声匿迹。水神共工不肯降服，女娲遣火神于不周山大败共工。共工兵败，以头撞山，至使天柱崩塌。女娲大怒，将其打入无尽海底，永不得重返神界。

天柱崩塌后的人间危在旦息，女娲持神剑斩地敖之足撑住塌下的天空，融五彩灵石补天。其后，又以补天所遗留的五彩灵石幻化为五行灵石，在蜀山建“镇妖塔”，将人间妖魔尽数擒入塔中。为防妖魔破塔遁逃，女娲令座下童子白眉持神剑立于塔前，威摄塔中妖魔。

百年后，白眉于蜀山金顶开创“蜀山派”，旨在镇守神塔，护卫人界清平。世人尊其道德高隆，称之为“仙师”，女娲神剑也由此而得名“仙剑”。

蜀山派的创立引得有志之士纷纷结庐修行、感悟天地间的玄妙。被女娲所降服的风、雷、火三神亦相助世人洞悉仙法奥妙。人界修为高者，可臻半神境界，称之为“仙”。仙者又以已度人，开宗立派教化世人。一时间，人间修仙之风鼎盛，大大小小的门派如同雨后春笋般拔地而起。

蜀山派的创立引得有志之士纷纷结庐修行、感悟天地间的玄妙。被女娲所降服的风、雷、火三神亦相助世人洞悉仙法奥妙。人界修为高者，可臻半神境界，称之为“仙”。仙者又以已度人，开宗立派教化世人。一时间，人间修仙之风鼎盛，大大小小的门派如同雨后春笋般拔地而起。

时至宋末，蜀山第十七代掌门误将女娲转世认做妖邪擒入镇妖塔中，此举招至天威震怒！降狂雷于蜀山。雷击之下，镇妖塔分崩离析，化为五行灵石飞散四方，镇塔仙剑亦下落不明，十万妖灵伺机破塔而出……

闯下弥天大祸的蜀山派，倾巢而出寻访五行灵石及仙剑下落，四方修行之人亦赶来相助，人界决意重建镇妖塔。与此同时，三界妖灵纷纷汇聚于中洲北部，结成同盟以阻止人界建塔之举……

三界生灵再次被推至战争的边缘，天、地、冥三界浮沉，皆系于失落的神物……而你，还在犹豫着什么？带着你的抉择与愿望，踏上《大话仙剑》奇幻的征程吧！